Работа организационно-методического отдела направлена на выполнение основных задач, поставленных Правительством и Министерством здравоохранения. Для оказания высококвалифицированной специализированной медицинской помощи детям и женщинам Пензенской области осуществляются плановые и экстренные выезды врачей — специалистов, проводятся выездные медицинские Советы, где рассматриваются актуальные вопросы работы в районах.

      Отдел занимается составлением годового отчета и анализом деятельности больницы на основании данных годового статистического отчета, текущей учетно-оперативной документации, разработкой показателей младенческой смертности, структуры смертности детей по районам области и г.Пенза.

      Проводится постдипломная учеба специалистов и врачей из межрайонных и районных больниц на базе ПОДКБ им. Н.Ф. Филатова.

      Организовываются выступления в средствах массовой информации, ведется разработка  методических рекомендаций а так же контроль ведения профилактической работы с пациентами в структурных подразделениях учреждения.